Obtenção de marcadores microssatélites para genotipagem e análise genética de Moniliophtora perniciosa em gel corado com prata. Boletim técnico N. 196

Abstract

Microssatélites constituem marcadores genéticos altamente informativos para estudos genéticos devido a sua natureza codominante, multialélica e pela ampla distribuição no genoma. Marcadores microssatélites (SSR) foram obtidos para Moniliophthora perniciosa a partir de seqüências de DNA genômico contidas no banco de dados deste fitopatógeno. Sessenta e quatro microssatélites com repetições de dois, três e quatro nucleotídeos foram amplificados utilizandose primers especificamente desenhados para amplificar as regiões que flanqueiam os microssatélites, visualizados em gel de agarose 3% e posterionnente corados com nitrato de prata em gel de poliacrilamida 6%. Dos 64 pares de primers desenhados, 28 geraram produtos de amplificação, sendo que 121ocos foram polimórficos. Os microssatélites com repetições de tetranucleotídeos apresentaram o mais alto nível de polimorfismo. A média de heterozigosidade variou de 0,02 a 0.5. Quando isolados de M. perniciosa de diferentes biótipos foram utilizados, encontrou-se três SSR altamente polimórficos. A maioria dos pares de primers gerou produtos de amplificação a partir de DNA genômico de Moniliophthora roreri, outro importante patógeno do cacau, indicando uma possível transferibilidade e utilidade dos primers em estudos genéticos deste fitopatógeno. A utilização de marcadores microssatélites em M. perniciosa abre uma ampla perspectiva para a geração de dados precisos sobre estrutura e variabilidade genética, fluxo gênico e paternidade em populações e isolados deste fitopatógeno, assim como para outros microrganismos.